Stavěn v barokním slohu. Je to hlavní kostel českobudějovické diecéze. Před katedrálou se nachází socha biskupa Jana Valeriána Jirsíka. V průčelí kostela jsou umístěny 3 sochy – sv. Václava (patrona české země), sv. Mikuláše (patrona českobudějovické diecéze) a sv. Auratiána (patrona Českých Budějovic).

Kostel byl několikráte významně přestavován. Dnešní podoba je až ze 17. století.

Za kostelem na východní straně stojí barokní kaple Smrtelných úzkostí Páně, vystavěna v letech 1727-1731 neznámým architektem.

Od května 2011 byla katedrála přestavována. Znovu nově otevřena od 1. června 2013.